每年12月到翌年4月间是蝠鲼的繁殖季节。此时热带海域的水温在26-29摄氏度间，蝠鲼开始成群出现在浅海区，通常是几只体型较小的雄性一起尾随在体型稍大的雌性身后，游速比平时略快。经过20-30分钟的追逐后，雌蝠鲼逐渐放慢速度，雄蝠鲼则游到爱人身下，并用胸鳍“爱抚”其身体。完成短暂的交配后，雄性则扬长而去，接下来第二个追求者会重演以上的过程。不过，雌蝠鲼最多只接受两个“意中人”的追求——1-2枚受精卵在雌性体内发育并孵化出仔鱼，大约13个月后，小蝠鲼会直接从母体中产出，不久就能自由游动，独闯天下了。小蝠鲼5岁时达到性成熟，适龄者便可延续自己的基因：它们的寿命约为20年。
蝠鲼的英文名称“manta”源于西班牙语，意为毯子，看看它的体型就知道了。又因其在海中优雅飘逸的游姿与夜空中飞行的蝙蝠相仿，故得此蝠鲼。第一次见到蝠鲼的人总会因它“异形”般的外表而不知所措，它很难令人将其与正统的鱼类联想到一起。其实，这种古老的鱼类早在中生代侏罗纪时便出现在海洋中了。1亿多年间，它们的体型几乎没有发生什么变化。从分类学上来说，蝠鲼和鲨鱼的亲缘关系最相近，同属软骨鱼纲，单属鲼形目蝠鲼科，现存3属13种，遍布于南北纬35度之间的大西洋、太平洋和印度洋海域。在中国东部和南部海域能见到4种：双吻前口蝠鲼、日本蝠鲼、蝠鲼和无刺蝠鲼。
蝠鲼主要栖居在热带和带的浅海区域，较少停留或栖息在海底，从离海岸较近的表水层到120米深的海水中都能看见它们的身影。
中国福建、浙江和黄海一带可见某些种类的踪影。因为它们有洄游的习惯，所以在一个地方不会常年见到它们。每年6～7月在福建、浙江沿海，8～9月又到黄海。10～11月再回到浙江沿海，12月到来年2～3月沿原来路线洄游南下。
鲼科蝠鲼属(Mobula)与蝠鲼科前口蝠鲼属(Manta)：
鲼科蝠鲼属的九个物种：无刺蝠鲼(Mobula mobular)、褐背蝠鱝(又名蝠鲼)(Mobula tarapacana)、日本蝠鲼(Mobula japonica)、侏儒蝠鲼Mobula eregoodootenkee、下口蝠鲼Mobula hypostoma、库氏蝠鲼Mobula kuhlii、芒基蝠鲼(Mobula munkiana、罗切氏蝠鲼Mobula rochebrunei、印度蝠鲼Mobula thurstoni
蝠鲼科前口蝠鲼属(又称鬼蝠属)仍在研究，只发现过三种：双吻前口蝠鲼(Manta birostris)(注：其中一种分类把前口蝠鲼属编在蝠鲼科中，另一种分类把前口蝠鲼属和蝠鲼属都编在鲼科之中)、Manta ehrenbergii和Manta raya，而且这三种非常相似。因此有时，它会独立成科，但大多数和鲼科的蝠鲼合并在一起。
物种保护
另外，亚洲地区部分居民有将蝠鲼腮作为药用的习惯，他们认为蝠鲼的鳃耙(硬骨鱼类每1个鳃弓的内缘生有两排并列的骨质突起，称为鳃耙。)拥有非常高的药用价值，因此蝠鲼市价很高，这也是它被渔民大量捕杀的原因。但是截止目前，并没有医学研究证明蝠鲼腮是否有药用价值。
2011年蝠鲼已被列入国际公约—保护迁徙野生动物物种公约(CMS)
国际自然生态保护联盟(IUCN)已将蝠鲼归类为濒危物种。曼塔信托基金是一个总部位于英国的慈善机构，致力于蝠鲼的研究和保护工作。该组织的网站也提供蝠鲼保护和生物学的信息资源。
2013年《濒危野生动植物种国际贸易公约》(CITES)将双吻前口蝠鲼和阿式前口蝠鲼两种前口蝠鲼作为濒危野生动物列入公约附录二。我国作为缔约国，将从2014年9月14日起对以上两种蝠鲼实施保护，对蝠鲼国际贸易进行监管。