在自然界里，水草原生的原生地“河川或湖泊”，时时都有新的水流入，水草利用水中含有的 CO2，及从太阳光的能量来行光合作用；根从土壤中吸收由微生物分解的有机物，另外叶子从水中吸收营养素，如此可有效抑制河川及湖泊的营养化。还有自然界中有无数的原生动物和微生物存在，可将有机物、浮游物有效分解，而净化了水质，如前所述，自然界本身就有一个平衡的生态系，具备水质净化的系统。
过滤的条件
但是在水族箱来说，是一个完全封闭的世界，不具备自然界良好的条件，因此在之中种植水草，非得人为添加CO2设置，多的灯光及完整的过滤设备不可。在此之中过滤装置于有限的水量，扮演一个维持平稳生态系重要角色。
如果鱼缸中的鱼及草的数量少时，其实使用何种过滤效果都差不多，但一般水草缸都希望有密植的水草，尤其是较矮的水草更需要有充足的光量，因此必须有充分置放灯具的空间，另外水草也需要充足CO2，故溶入水中的CO2要尽量避免逸散，根据以上的需求来定出过滤器所需的条件：
1、有充分放置照明设备的空间；
2、CO2不易逸散；
3、维持长期的高过滤能力。
过滤器的种类及优缺点
从以上所需条件来看，何种为适用的种类？请参考以下说明：
一、上部过滤
因设置于鱼缸上部，照明设备所能放置的空间减少（特别是萤光灯具），如果水草密植要考虑到光量不足的现象，在过滤器的构造上，水通过过滤槽时会与空气接触，如此CO2也会随之逸散到空气中。
优点：
1、因为是装置在鱼缸上部，故在清洁保养上非常方便；
2、在构造上容易将CO2逸散，对于养鱼来说非常适合。
缺点：
1、在构造上CO2与空气接触面积大，易逸散掉；
2、在照明设备的放置空间会受限，不适合水草的培育。