金鱼的品系大体可分为草种、文种、龙种、蛋种和龙背种五大类。其中,草种金鱼,又称金鲫种,是金鱼的祖先,其外观体形似鲫鱼,身体扁平纺锤形,背鳍正常,尾鳍单一。特征是体形近似鲫鱼,具备背鳍和尾鳍叉形,有单叶。草金鱼的尾鳍有长尾和短尾之分,其中短尾者一般称为草金鱼,而长尾者则被称作长尾草金鱼或燕尾,因为其耳朵状的后部与家燕的羽毛相似,因此得名。此外,在英美地区,这些生物也被称作“彗星”。据记载,最早发现这种生物是在中国晋朝时期,大约在公元265年至420年间。
文种金鱼则以其身体较短且各个鳍较长而著称,它们具有背鳍和双叉型的尾鳍,并且眼球平直,不突出。其中最珍贵的一些品种包括鹤顶红及珍珠等。这类生物在历史上被记录成于陈善1579年的《万历杭州府志》中,该文献提到双头或五头(即多头)的奇异现象,但明朝弘治及正德时期(1488-1521年)尚未出现双头或多头现象,所以这些奇异现象是在1521年之后至1579年前才逐渐培育出来。而双臀及长翅膀,则更晚才出现。
龙種金魚則與文種相似,但它們的眼睛凸出於眶外。在古代,被視為真實純淨之物自古以来视龙种为真正纯净无瑕之物。这类生物共有50多个品種,其中最值钱的是风镜龍睛、黑龍睛、喜鵲龍睛、瑪瑙眼葡萄眼灯泡眼等。这类生物特征是:體型粗短頭平而寬各個鰓發達;眼睛呈不同形狀,有圆球形梨形圆筒形葡萄形式膨大的突出於眶外;臀鰓與後鰓都成雙伸長後鰓四葉胸鰓呈三角狀;背鰓高耸。
蛋種 金魚則與鮭魚有很大差異,它們體型較短而肥,並且眼睛不凸出並無背骨。這類動物中最珍貴的是紅蛋綿繡蛋風鈴目蘭壽等。這類動物特點是不具備背骨,全身縮短圓如鸭卵樣。後脊部份略微隆起形成弧線最高點位於脊椎中央處。
最後來到龍背種 金魚,這類動物與蛋種相似但它們眼睛凸出於眶外。不論是哪一個品種,都會給人留下深刻印象。一共有七個不同的樣式,一般稱為「龍」、「虎頭」、「燈泡」、「翻轉」、「頭頂」或者「角膜」。每一個都是獨一無二的地方,每一隻都像是一幅精緻的小畫片,用以表現自然界中的豐富變化和多樣性。